固定資產盤點是財務審計的重要環節，而儀器設備又是固定資產的重要組成部分，由于它的特殊性，在固定資產盤點中，應注意以下幾個環節。

一是精心制定盤點計劃，召集相關人員，了解儀器設備主要用途，存放地點及數量，然后與儀器設備資產賬進行核對，選擇金額大、關鍵儀器設備進行盤點，并制作盤點表備用。

二是明確專業人員要參與盤點，由于財務人員對專業儀器設備不是很了解，儀器設備的盤點應有專業人員在場，對儀器設備的型號進行指認。審計人員要將資產帳面型號與實際存在的儀器設備型號進行核對，避免張冠李戴，確保賬實相符。

三是選擇恰當的盤點時間，一些儀器設備，如安裝在專用車輛上的環保檢測設備，由于需要進行流動檢測，因此，應選擇該車輛在單位的時候進行盤點，如遇特殊情況，應詢問該車輛的檢測地點，審計人員可以到檢測現場進行盤點，以確定該資產是否存在及完整。

通過以上幾個環節，基本可以對儀器設備的真實性進行確認并發表意見。